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/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9408c.zip / M9480469.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-20  |  2KB  |  33 lines
  1.        Document 0469
  2.  DOCN  M9480469
  3.  TI    Footprinting RNA-protein complexes following gel retardation assays:
  4.        application to the R-17-procoat-RNA and tat--TAR interactions.
  5.  DT    9410
  6.  AU    Pearson L; Chen CB; Gaynor RP; Sigman DS; Department of Biological
  7.        Chemistry, School of Medicine,; University of California, Los Angeles
  8.        90024-1570.
  9.  SO    Nucleic Acids Res. 1994 Jun 25;22(12):2255-63. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/94310052
  11.  AB    RNA-protein complexes isolated following a gel retardation assay can be
  12.        footprinted within the gel matrix using the chemical nuclease activities
  13.        of 4,7-dimethyl-, 5,6-dimethyl-, and
  14.        3,4,7,8-tetramethyl-1,10-phenanthroline-copper. These complexes are more
  15.        reactive than 1,10-phenanthroline-copper but share its reaction
  16.        preference for bulges and loops. The interaction of the coat protein of
  17.        R-17 with its viral RNA target and tat- and tat-derived peptides with
  18.        HIV TAR RNA have been studied. In both cases, the RNA sequence opposite
  19.        a 2-3 nucleotide bulge are protected. Tat-derived peptides inhibit
  20.        cleavage at sites which intact tat does not protect. These results are
  21.        consistent with transcription studies which have suggested that
  22.        truncation of tat increases nonspecific binding.
  23.  DE    Amino Acid Sequence  Bacterial Proteins/*METABOLISM  Base Sequence
  24.        Capsid/*METABOLISM  Cell Line  Copper/METABOLISM  DNA  Gene Products,
  25.        tat/*METABOLISM  Genetic Techniques  Membrane Proteins/*METABOLISM
  26.        Molecular Sequence Data  Phenanthrolines  Ribonucleases/METABOLISM
  27.        RNA-Binding Proteins/*METABOLISM  RNA, Viral/*METABOLISM  Support, U.S.
  28.        Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  29.  
  30.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  31.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  32.  
  33.